С ispconfig не работал, работал с cPanel, DirectAdmin, Webmin. Из них наиболее удобная для меня была DirectAdmin, потом cPanel (но правда последний раз ее юзал около 8-и лет назад). А webmin шляпа полная. Именно после webmin я полностью на серваках перешел на консольную работу, т.к. в webmin что-то сделать это пиз...ц полный. Но консоль удобна когда свой сервак и сайт свой (или несколкьо), а когда барыжишь хостингом, т.е. реселлер, то там конечно нужна панелька для автоматизации рутины. В этом плане вебмин также крайне не советую.